O principal vexame do Palmeiras na Copa do Brasil aconteceu em 2003. Em pleno Parque Antarctica, a equipe do então treinador Jair Picerni tomou uma goleada de 7 a 2 do Vitória, com direito a chute no vácuo de Marcos no último gol. O atacante Nádson, do Vitória, foi o destaque da partida com quatro gols. 
O segundo grande fracasso do Palmeiras na Copa do Brasil foi a eliminação diante do modesto Asa de Arapiraca em 2002 ainda na primeira fase. A equipe alviverde perdeu fora de casa por 1 a 0 e parecia tranquila para decidir no parque Antarctica a classificação. No entanto, a vitória por 2 a 1 não foi suficiente e o gol como visitante acabou premiando o Asa, que seguiu na competição.para ver o post inteiro clike em mais informações.
O Coritiba não tomou conhecimento do Palmeiras na primeira partida das quartas de final da Copa de Brasil e aplicou uma goleada de 6 a 0 no Couto Pereira. A equipe paulista agora precisa de um improvável 7 a 0 (para avançar diretamente) ou 6 a 0 para levar para os pênalits contra o recordista de vitórias seguidas na temporada do futebol brasileiro. 
Em 2007, o Palmeiras, novamente em casa, foi eliminado da competição pelo Ipatinga. O clube paulista superou o adversário por 2 a 0 no Parque Antarctica no tempo normal, mas como devolveu o mesmo placar do confronto de ida, em Minas Gerais, decidiu a vaga nos pênaltis. Nas cobranças, perdeu por 4 a 3 e encerrou sua participação no certame nacional. 
No ano passado, o Palmeiras também foi eliminado da competição nas quartas de final por um time considerado inferior, o Atlético-GO. Na segunda partida, a equipe paulista jogava pelo empate, mas acabou sendo derrotada por 1 a 0 no estádio Serra Dourada, levando a decisão para os pênaltis. Nas penalidades, o time de Goiás levou a melhor e vendeu por 2 a 1. 
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